La carrera de Ingeniería Bioquímica (IBQ) fue creada en el año de 1980 en esta universidad, debido a la creciente demanda de un profesionista que tuviera capacidad para incursionar en el desarrollo de la industria vitivinícola y alimentaria de la región. Por tanto la currícula inicial estaba enfocada a dar una fuerte preparación al área de ingeniería o del diseño y aspectos de aplicación de tecnologías de fermentación alcohólica e industrialización de alimentos convencionales. En los primeros años los estudiantes diseñaron y construyeron equipos propios de la Ingeniería Bioquímica tales como, fermentadores, torre de enfriamiento, aparato de Reynolds, evaporador, etc. dentro de un programa de autoequipamiento que se tenía en aquellos años para lograr, por un lado la titulación por tesis de los alumnos y por otro lado el equipamiento de los laboratorios principalmente el de Operaciones Unitarias el cual requiere de equipos costosos. El programa de autoequipamiento concluyó y actualmente contamos con equipos fabricados ex profeso para fines didácticos por compañías especializadas. A casi cuatro décadas de esa concepción del IBQ, se han presentado cuatro revisiones al plan de estudios para tratar de adecuar la formación de los egresados a los cambios y necesidades del medio. Los documentos creados quedan como memoria de este proceso de evolución del IBQ formado en la UAA. Actualmente el plan de estudios vigente es el Plan 2012 y para el 2018 se espera trabajar sobre el rediseño del Plan de Estudios.

Transmitir el conocimiento del área biológica e ingenieril a los alumnos de las carreras que apoyamos, para que estos puedan resolver la problemática de la industria local y regional, relacionada con la aplicación de los fundamentos teóricos, así como el desarrollo e innovación de la tecnología de procesos bioquímicos con profesionalismo y ética, en organizaciones nacionales e internacionales. Así mismo, realizar investigaciones que generen nuevo conocimiento que permita el avance en esta área del conocimiento.

Contribuir con el desarrollo de la ciencia y la tecnología en las áreas de biotecnología, ingeniería y tecnología de alimentos para que sean pertinentes y competitivos a nivel estatal, nacional e internacional, en el campo de la ingeniería bioquímica.

Se tienen dos tutores longitudinales que atienden a los alumnos de la carrera de Ingeniero Bioquímico, uno de ellos los introduce a la vida universitaria y el otro los prepara para el egreso exitoso. Además hay un tutor de servicio social y uno más de prácticas profesionales.